Program ESL (English as a Second Language) di Junior High School Global Islamic School 3 Yogyakarta (JHS GIS 3 Yogyakarta) adalah program pembelajaran Bahasa Inggris yang menghadirkan pengajar Native Speaker dari negara-negara berbahasa Inggris, seperti Inggris, Australia, dan Amerika Serikat. Program ini merupakan salah satu pilar keglobalan GIS yang menekankan penguasaan bahasa Inggris sebagai keterampilan penting dalam era globalisasi. Pembelajaran ini mencakup pengembangan empat keterampilan utama yakni speaking, listening, reading, dan writing, yang dirancang untuk memperkuat kemampuan berbahasa Inggris siswa secara menyeluruh.

Dilaksanakan setiap minggu selama satu jam pelajaran, program ini bertujuan untuk meningkatkan kepercayaan diri dan keterampilan komunikasi siswa agar mampu berbahasa Inggris aktif dan natural layaknya penutur asli. Dengan adanya program ini, diharapkan siswa JHS GIS 3 Yogyakarta memiliki kemampuan Bahasa Inggris yang kuat dan siap bersaing di kancah global.